Па паходжанні і хімічных уласцівасцях адрозніваюць арганічныя і неарганічныя пігменты.
Крыніца: арганічныя пігменты здабываюць або сінтэзуюць з жывёл, раслін, мінералаў або штучна сінтэзаваных арганічных злучэнняў. Неарганічныя пігменты здабываюць або сінтэзуюць з руд, мінералаў або сінтэтычных неарганічных злучэнняў.
Хімічныя ўласцівасці: Малекулы арганічных пігментаў звычайна складаюцца са складаных структур, якія змяшчаюць вуглярод, і іх колер вызначаецца хімічнай структурай арганічнага злучэння. Малекулы неарганічных пігментаў звычайна складаюцца з неарганічных элементаў, а іх колер вызначаецца ўласцівасцямі і структурай элементаў.
Стабільнасць: неарганічныя пігменты, як правіла, больш устойлівыя, чым арганічныя пігменты, і больш устойлівыя да святла, кіслаты, шчолачы і цяпла. Арганічныя пігменты могуць разбурацца або змяняць колер пры пэўных умовах. Дыяпазон колераў: з-за адрозненняў у іх хімічнай структуры арганічныя пігменты звычайна маюць больш шырокі дыяпазон колераў, што дазваляе атрымліваць больш яркія колеры. Неарганічныя пігменты маюць параўнальна вузкі спектр колераў. Вобласці прымянення: арганічныя пігменты падыходзяць для фарбавальнікаў, фарбаў, пластмас, паперы і іншых галінах. Неарганічныя пігменты шырока выкарыстоўваюцца ў кераміцы, шкле, пігментах, пакрыццях і іншых галінах.

Варта адзначыць, што як арганічныя, так і неарганічныя пігменты маюць свае перавагі і характарыстыкі, і выбар таго, які пігмент выкарыстоўваць, залежыць ад канкрэтных патрэб прымянення і жаданага эфекту.